Pembinaan Muallaf merupakan salah satu program BAZNAS Kota Palangka Raya. beberapa agenda yang temasuk dalam Program Pembinaan Muallaf diantaranya adalah pembagian paket bantuan untuk muallaf. Adapun Program Pembinaan Muallaf yang telah dilakukan diantaranya:

1. Penyaluran Paket Muallaf kepada KUA Kecamatan Jekan Raya

2. Penyaluran Paket Muallaf ke Perwakilan KUA Kecamatan Sebangau

3. Penyaluran Paket Muallaf kepada KUA Kecamatan Rakumpit